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add_improper_constraint(Particle_rep p, Particle_rep q, Particle_rep r, Particle_rep s) | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | inline |
add_particle(const Particle_info &info) | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | inline |
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dihedral_angles_end(bool is_embedded=true) const | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | inline |
Dihedral_angles_iterator typedef | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | |
DOUBLE_BOND enum value | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | |
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get_sub_structure(InputIterator begin, InputIterator end, Self &S) | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | |
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get_x(Conformation &C, Particle_rep p) const | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | inline |
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get_y(Conformation &C, Particle_rep p) const | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | inline |
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get_z(Conformation &C, Particle_rep p) const | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | inline |
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Particles_iterator typedef | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | |
Particles_iterator_base typedef | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | |
print(std::ostream &out) const | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | |
Self typedef | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | |
set_particle_position(Particle_rep p, int position) | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | inline |
SIMPLE_BOND enum value | T_Molecular_covalent_structure< ParticleInfo > | |
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